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翻译|使用教程|编辑:杨鹏连|2020-08-03 11:54:45.760|阅读 367 次
概述:在本教程中,我们将向您展示如何在Javascript中创建交互式内核密度估计并使用Highcharts库绘制结果。
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Highcharts是一款纯JavaScript编写的图表库,为你的Web网站、Web应用程序提供直观、交互式图表。当前支持折线、曲线、区域、区域曲线图、柱形图、条形图、饼图、散点图、角度测量图、区域排列图、区域曲线排列图、柱形排列图、极坐标图等几十种图表类型。
内核密度估计是一种有用的统计方法,用于估计随机变量分布的总体形状。换句话说,核密度估计(也称为KDE)可帮助我们“平滑”和探索不遵循任何典型概率密度分布(例如正态分布,二项式分布等)的数据。
在本教程中,我们将向您展示如何在Javascript中创建交互式内核密度估计并使用Highcharts库绘制结果。
让我们首先探索KDE图;然后我们将深入研究代码。
下面的演示显示了随机数据集的高斯核密度估计:
基本上,对于每个红色数据点,我们用橙色绘制一个高斯核函数,然后将所有核函数求和在一起,以蓝色创建密度估计值(请参见demo):
现在,您对内核密度估计的外观有了一个想法,让我们看一下其背后的代码。
代码中有四个主要步骤:
以下代码表示高斯内核函数:
function GaussKDE(xi, x) { return (1 / Math.sqrt(2 * Math.PI)) * Math.exp(Math.pow(xi - x, 2) / -2); }其中x表示主要数据(观测值),xi表示绘制内核的范围和密度估计函数。在我们的情况下,xi范围是88到107,以确保覆盖93到102的观测数据范围。
密度估算点
以下循环使用GaussKDE()数组表示的函数和范围创建密度估计点
xiData:
//Create the density estimate
for (i = 0; i < xiData.length; i++) {
let temp = 0;
kernel.push([]);
kernel[i].push(new Array(dataSource.length));
for (j = 0; j < dataSource.length; j++) {
temp = temp + GaussKDE(xiData[i], dataSource[j]);
kernel[i][j] = GaussKDE(xiData[i], dataSource[j]);
}
data.push([xiData[i], (1 / N) * temp]);
}
内核点
仅当您想要显示内核点(橙色图表)时才需要执行此步骤。否则,您已经对密度估算步骤很满意。这是处理每个内核的数据点的代码:
//Create the kernels for (i = 0; i < dataSource.length; i++) { kernelChart.push([]); kernelChart[i].push(new Array(kernel.length)); for (j = 0; j < kernel.length; j++) { kernelChart[i].push([xiData[j], (1 / N) * kernel[j][i]]); } }基本上,此循环仅是将范围添加xiData到kernel在密度估计步骤中已处理的每个阵列。
绘制点
处理完所有数据点后,就可以使用Highcharts渲染系列了。密度估计和核是样条图类型,而观测值则绘制为散点图:
Highcharts.chart("container", { chart: { type: "spline", animation: true }, title: { text: "Gaussian Kernel Density Estimation (KDE)" }, yAxis: { title: { text: null } }, tooltip: { valueDecimals: 3 }, plotOptions: { series: { marker: { enabled: false }, dashStyle: "shortdot", color: "#ff8d1e", pointStart: xiData[0], animation: { duration: animationTime } } }, series: [ { type: "scatter", name: "Observation", marker: { enabled: true, radius: 5, fillColor: "#ff1e1f" }, data: dataPoint, tooltip: { headerFormat: "{series.name}:", pointFormat: "<b>{point.x}</b>" }, zIndex: 9 }, { name: "KDE", dashStyle: "solid", lineWidth: 2, color: "#1E90FF", data: data }, { name: "k(" + dataSource[0] + ")", data: kernelChart[0] },... ] });现在,您准备使用核密度估计图的功能来探索自己的数据。
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