原创|行业资讯|编辑:陈俊吉|2017-02-16 10:31:11.000|阅读 805 次
概述:最近在网上到处了解和爬一些R的资料,看着看着就入迷了,这就是个大宝库了,以前怎么没发现,看来还是太狭隘了。直到前几天我看到这个Awesome R文档,我就静不下来了,对比了目前自己的工作和以后的方向,非常适合我。所以毫不犹豫的把这个文档汉化了,所以大家一起享受吧。
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虽然很早就知道R被微软收购,也很早知道R在统计分析处理方面很强大,开始一直没有行动过。。。直到
直到12月初在微软技术大会,看到我软的工程师演示R的使用,我就震惊了,然后最近在网上到处了解和爬一些R的资料,看着看着就入迷了,这就是个大宝库了,以前怎么没发现,看来还是太狭隘了。直到前几天我看到这个Awesome R文档,我就静不下来了,对比了目前自己的工作和以后的方向,非常适合我。所以毫不犹豫的把这个文档汉化了,所以大家一起享受吧。
这里有很多非常不错的R包和工具. 该想法来自于.
这里是包的导航清单,看起来更方便
通过这些翻译了解这些工具包,以后干活也就方便多了。不过翻译这个东西的确要靠耐心,翻译,编辑花费了至少一周的空余时间。
在编辑本文的过程中,惊喜的发现Awesome系列的其他资源:地址在github:
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RStudio – 一个非常强大高效的图形界面开发环境,可以在Windows, Mac, 和Linux运行.
Emacs + ESS – ESS是一个emacs文本编辑器的一个统计分析的插件.
Sublime Text + R-Box – 一个在Sublime 2/3中使用R语言编程的插件.
TextMate + r.tmblundle – TextMate 1/2的插件.
StatET – 一个基于Eclipse的R语言IDE.
Revolution R Enterprise – 专注于大数据,大规模多处理器的功能,可以对学术用户免费提供和商业使用.
R Commander – 一个包括基本图形用户界面的R包.
IRkernel – Jupyter的R语言内核.
Deducer – 一个菜单驱动的数据分析的GUI工具,类似电子表格数据编辑器.
Radiant – 一个使用R语言,独立的基于浏览器接口的业务分析平台,基于Shiny.
Vim-R – Vim中R语言插件.
Nvim-R – Neovim中R语言插件.
JASP – 一个完整的贝叶斯和概念论相关方法的R包,和使用SPSS非常相似。
Bio7 – 一个包括创建,科学图像分析和统计分析的IDE.
RTVS – Visual Studio中R开发工具.
magrittr – 一个R语言高效的管道操作包.
pipeR – 多泛型管道的实现.
lambda.r – R语言中函数式编程和简单的模式匹配.
purrr – 一个高级函数编程语言包.
dplyr – 快速数据操作和数据库查询.
data.table – 使用短小灵活的语法操作数据.
reshape2 – 灵活的数据排列,聚合处理.
readr – 一个快速简单的读取表格数据到R中的包.
haven – 对导入SPSS,STATA和SAS的文件进行改进.
tidyr – 方便对数据进行整理、传播和收集.
broom – 将统计分析对象转换成整齐的数据框(一种数据组织和呈现的方式).
rlist – 一个操作非规范化数据的工具箱.
jsonlite – 一个快速解析JSON文件的包.
ff – 设计用来存储大型数据集的数据结构.
lubridate – 一组日期和时间函数.
stringi – 基于ICU的字符串处理方案.
stringr – 基于stringi之上的对字符串处理API.
bigmemory – 提供共享内存和内存映射矩阵,同时也包提供额外的工具,包括线性模型.(biglm) 和随机森林 (bigrf).
fuzzyjoin – 使用不精确匹配的方式连接表数据.
tidyverse – 简单从tidyverse下载和安装包.
ggplot2 – 强大的绘图统计和计算图形系统的实现.强烈推荐.
ggfortify -一个ggplot2(流行的统计软件包)统一的接口(使用一行代码即可).
ggrepel – 排除重叠的文本标签.
ggalt – ggplot2额外的坐标系统,几何和统计.
ggtree – 可视化和注释的系统树.
ggplot2 Extensions – ggplot2扩展显示例子.
lattice – 一个强大优雅的高级数据可视化系统.
corrplot – 图形显示相关矩阵或一般矩阵。它还包含一些矩阵重新排序算法.
rgl – R中3D可视化系统.
Cairo – 一个使用cairo组件创建高质量显示输出的R图形包.
extrafont – 在R中图像中使用字体的工具.
showtext – 让R图形设备显示文本的时候使用系统字体.
animation – 一个使用 ImageMagick在R中产生动画图形的工具.
gganimate – 用ggplot2创建简单的动画. >>>官网
misc3d – 强大的3D绘图工具.
xkcd – 在图表中使用xkcd风格.
imager – 一个基于CImg库的图像处理包.
d3heatmap – 使用D3绘制互动的热图.
DataTables – 将R矩阵或数据框作为交互的HTML表.
DiagrammeR – 在R中创建JS图表和流程图.
dygraphs – 在R中绘制时间序列数据图形.
formattable – 可格式化的数据结构.
ggvis – R中交互式的图形处理语法.
Leaflet – 一个非常流行的交互式地图JavaScript组件.
MetricsGraphics – 可以轻松创建D3散点图、折线图和直方图.
networkD3 – D3 JavaScriptR网络图.
scatterD3 – D3 互动散点图.
plotly – 使用plot.ly进行交互式ggplot2和Shiny绘图.
rCharts – 交互式JS绘图.
rbokeh – Bokeh的R接口.
threejs – 交互式3D散点图和地球仪.
timevis – 创建完全交互式的时间轴可视化图形.
visNetwork – 使用vis.js类库进行网络可视化.
knitr – R中简单的动态报表生成工具.
xtable – 将表格导出到LaTeX或者HTML.
rapport – 一个R模版系统.
rmarkdown – R动态文档工具.
slidify – 创建和发布漂亮的html5展示效果.
Sweave – 使用R创建LaTeX报表的R包.
texreg – 在LaTex和HTML中格式化统计模型.
checkpoint – 从检查点快照服务器安装包.
brew – 报告模板的生成框架.可以和knitr合并.
ReporteRs – 一个生成微软Word, PowerPoint和HTML报表的R包.
bookdown – 使用R Markdown编写书籍.
ezknitr – 避免使用’knitr’带来的工作目录的痛苦.
Web Technologies List – 关于如何使用R和网络的相关信息.
shiny – 使用R创建简单的Web交互应用.
RCurl – 常规的网络客户端接口 (HTTP/FTP/…) .
httr – 使用更加友好的RCurl封装.
httpuv – HTTP和WebSocket服务程序.
XML – R中生成和解析XML的工具.
rvest – 简单的web信息抓取,使用CSSSelect 和 XPath 语法.
OpenCPU – HTTP API.
Rfacebook – Facebook API.
RSiteCatalyst – Adobe 分析服务的R语言客户端.
plumber – 一个将现有的R代码转换为API的包.
parallel – R语言高性能的并行计算平台. multicore and snow.
Rmpi – Rmpi对MPI APIS提供了一个包装过的接口,它也提供一个交互式的R环境.
foreach – 使用并行来执行循环.
SparkR – R for Spark.
DistributedR – 一个来自惠普Vertica Analytics团队的可伸缩的高性能平台.
ddR – 提供分布式数据结构,简化了R中的分布式计算.
sparklyr – 来自RStudio的Spark接口.
Rcpp – Rcpp在R中提供了一个高效的API,使得函数更快执行.
Rcpp11 – Rcpp11完全重新设计,以C++11为目标.
compiler – 使用JIT提高R代码的速度.
APIrJava – R语言对JAVE接口.
jvmr – 集成了R, Java, and Scala.
rJython – R语言对Python/Jython的接口.
rPython – 允许R调用Python.
runr – 在R中运行Julia和Bash.
RJulia – R中调用Julia.
RinRuby – 一个Ruby库,整合了R用Ruby解释器.
R.matlab – 读写mat文件,将R和Matlab连接到一起.
RcppOctave -Octave and Matlab的接口.
RSPerl – 双向接口,R中调用Perl和在Perl中调用R.
V8 – 嵌入JavaScript引擎.
htmlwidgets – R中把JavaScript数据可视化的最好方法.
rpy2 – Python对R的接口.
RODBC – R中ODBC数据库范围.
DBI – 在R和数据库管理系统之间定义一个公共的接口.
elastic – Elasticsearch HTTP API的包装器.
mongolite – R中Mongo客户端.
RMySQL – R语言的MySQL数据库接口.
ROracle – R中Oracle数据库的接口.
RPostgreSQL – R语言的PostgreSQL数据库系统接口.
RSQLite – R语言SQLite数据库接口.
RJDBC – 通过JDBC接口访问数据库.
rmongodb – R中MongoDB驱动.
rredis – R中Redis驱动.
RCassandra -Apache Cassanda直接接口(不是JAVA),提供了最多的基本功能.
RHive – 通过Apache Hive的R扩展促进分布式计算.
RNeo4j – Neo4j图形数据库驱动.
AnomalyDetection – 来自Twitter的AnomalyDetection R包.
ahaz – 半参数添加风险回归的正则化.
arules – 挖掘关联规则和频繁项集.
bigrf – 大随机森林:大型数据集的分类和回归森林.
bigRR – 广义回归(特殊是在p >> n情况下).
bmrm – 风险最小化方案的正规化方法.
Boruta – 所有相关的特征选择算法的一个封装 .
BreakoutDetection – Breakout Detection via Robust E-Statistics from Twitter.
bst – 梯度增加.
CausalImpact – 利用贝叶斯时间序列结构模型进行因果推断.
C50 – C5.0决策树和基于规则的模型.
caret – 分类和回归训练.
CORElearn – 分类、回归、特征评价和排序.
CoxBoost – Cox models by likelihood based boosting for a single survival endpoint or competing risks.
Cubist – 规则和基于实例的回归建模.
e1071 – Misc统计函数 (e1071),主要功能有类别分析、傅里叶变换,模糊聚类,支持向量机,最短路径计算,朴素贝叶斯分类器等等.
earth – 多元自适应回归模型.
elasticnet – 稀疏估计和稀疏主成分分析.
ElemStatLearn – 书籍”The Elements of Statistical Learning, Data Mining, Inference, and Prediction”中的数据集,函数和例子.
evtree – 全局最优树的进化学习.
forecast – 使用ARIMA, ETS, STLM, TBATS,和神经网络进行时间序列预测.
forecastHybrid – 使用”forecast”包对ARIMA, ETS, STLM, TBATS,和神经网络模型进行交叉检验.
FSelector – 一个基于subset-search或特性排名方法的特征选择框架.
frbs – 使用模糊规则系统处理分类和回归的任务.
GAMBoost - 基于广义线性和加法模型.
gamboostLSS – GAMLSS方法的改善.
gbm – 改善广义线性模型.
glmnet – Lasso 和 elastic-net正规化广义线性模型.
glmpath – L1 Regularization Path for Generalized Linear Models and Cox Proportional Hazards Model.
GMMBoost – 广义混合模型.
grplasso – Fitting user specified models with Group Lasso penalty.
grpreg – Regularization paths for regression models with grouped covariates.
h2o – Deeplearning, Random forests, GBM, KMeans, PCA, GLM.
hda – 异方差判别分析.
ipred – 预测器改进.
kernlab – kernlab: 基于内核学习的机器实验室.
klaR – 分类和可视化.
kohonen – 监督和非监督自组织映射.
lars – Least Angle Regression, Lasso and Forward Stagewise.
lasso2 – L1 constrained estimation aka ‘lasso’.
LiblineaR – 基于C/C++库的线性预测模型.
lme4 – Mixed-effects models.
LogicReg – 逻辑回归模型.
maptree – 映射、修剪和图形树模型.
mboost – Model-Based Boosting.
Machine Learning For Hackers
mvpart – Multivariate partitioning.
MXNet – MXNet brings flexible and efficient GPU computing and state-of-art deep learning to R.
ncvreg – Regularization paths for SCAD- and MCP-penalized regression models.
nnet – eed-forward Neural Networks and Multinomial Log-Linear Models.
oblique.tree – Oblique Trees for Classification Data.
pamr – Pam: 小矩阵预测分析.
party – A Laboratory for Recursive Partytioning.
partykit – A Toolkit for Recursive Partytioning.
penalized – L1 (lasso and fused lasso) and L2 (ridge) penalized estimation in GLMs and in the Cox model.
penalizedLDA – Penalized classification using Fisher’s linear discriminant.
penalizedSVM – 使用惩罚函数的特征选择支持向量机.
quantregForest – quantregForest: Quantile Regression Forests.
randomForest – 随机森林: Breiman and Cutler’s random forests for classification and regression.
randomForestSRC – randomForestSRC: Random Forests for Survival, Regression and Classification (RF-SRC).
rattle – 图形界面式的数据挖掘工具.
rda – Shrunken Centroids Regularized Discriminant Analysis.
rdetools – Relevant Dimension Estimation (RDE) in Feature Spaces.
REEMtree – Regression Trees with Random Effects for Longitudinal (Panel) Data.
relaxo – Relaxed Lasso.
rgenoud – R version of GENetic Optimization Using Derivatives.
rgp – R基因编程框架.
Rmalschains – 使用本地文化基因算法进行连续问题优化.[这里翻译不准]. Search Chains (MA-LS-Chains) in R.
rminer – 在分类和回归问题中简单的使用数据挖掘方法(如神经网络和支持向量机).
ROCR – 可视化评分分类器的性能.
RoughSets – 使用粗糙集和模糊粗糙集理论进行数据分析.
rpart – Recursive Partitioning and Regression Trees.
RPMM – Recursively Partitioned Mixture Model.
RSNNS – Neural Networks in R using the Stuttgart Neural Network Simulator (SNNS).
Rsomoclu – Parallel implementation of self-organizing maps.
RWeka – Weka的R接口(Weka是基于JAVA环境下开源的机器学习以及数据挖掘软件).
RXshrink – RXshrink: Maximum Likelihood Shrinkage via Generalized Ridge or Least Angle Regression.
sda – Shrinkage Discriminant Analysis and CAT Score Variable Selection.
SDDA – Stepwise Diagonal Discriminant Analysis.
SuperLearner and subsemble – Multi-algorithm ensemble learning packages.
svmpath – svmpath: the SVM Path algorithm.
tgp – Bayesian treed Gaussian process models.
tree – 分类和回归树.
varSelRF – 使用随机森林进行变量选择.
xgboost – eXtreme Gradient Boosting Tree model, well known for its speed and performance.
text2vec – 一个快速文本挖掘框架。 Fast Text Mining Framework for Vectorization and Word Embeddings.
tm – 一个全面的文本挖掘框架.
openNLP – Apache OpenNLP工具接口.
koRpus – 一个文本分析的R包.
zipfR – 词频分布统计模型.
NLP – 基本自然语言处理功能.
LDAvis – 主题模型的交互式可视化.
topicmodels – Topic modeling interface to the C code developed by by David M. Blei for Topic Modeling (Latent Dirichlet Allocation (LDA), and Correlated Topics Models (CTM)).
syuzhet – Extracts sentiment from text using three different sentiment dictionaries.
SnowballC – Snowball stemmers based on the C libstemmer UTF-8 library.
quanteda – 文本数据的定量分析.
Topic Models Resources – 主题模型的学习和R相关资源.
NLP for – NLP related resources in R. @Chinese.
coda – 输出MCMC(马尔可夫链蒙特卡尔理论)的分析和诊断信息.
mcmc – 马尔可夫链蒙特卡尔理论(MCMC).
MCMCpack – 马尔可夫链蒙特卡尔理论 (MCMC).
R2WinBUGS – 在在R/S-PLUS中打开WinBUGS 和 OpenBUGS.
BRugs – OpenBUGS MCMC 软件的R接口.
rjags – JAGS MCMC组件的R接口.
rstan – Stan MCMC软件的R接口.
minqa – Derivative-free optimization algorithms by quadratic approximation.
nloptr – 一个免费开源的非线性最优化程序包.
lpSolve – Lp_solve解决线性和整形问题的R接口.
quantmod – 定量金融模型和交易框架.
TTR – 技术交易规相关的数据和功能函数.
PerformanceAnalytics – 计量经济学性能和风险分析工具.
zoo – S3 Infrastructure for Regular and Irregular Time Series.
xts – 可扩展的时间序列.
tseries – 金融时间序列分析和计算.
fAssets – 金融资产分析和建模.
Bioconductor – 用于分析和理解高通量基因组数据的工具.
genetics – 处理基因数据的R包.
gap – 一个人口家庭遗传数据分析的综合工具.
ape – 分子系统学和进化分析.
pheatmap – 一个使用简单的热图工具.
ddpcr – Analysis and visualization of Droplet Digital PCR data.
Network Analysis List – 网络分析相关资源.
igraph – 一个网络分析工具集合.
network – 一个操作数据关系的基本工具.
sna – 基本的网络测量和可视化工具.
netdiffuseR – 网络扩散的分析工具.
networkDynamic – 支持动态和时序网络.
ndtv – 构建动画的可视化动态网络工具,支持多种数据格式.
statnet – 大量网络数据的分析,仿真和可视化工具.
ergm – 指数随机图模型.
latentnet – Latent position and cluster models for network objects.
tnet – Network measures for weighted, two-mode and longitudinal networks.
rgexf – 从R导出网络对象到GEXF, for manipulation with network software like Gephi or Sigma.
visNetwork – 使用vis.js类库进行网络可视化.
Package Development List – 提高整体开发能力的包.
devtools – 然R开发人员的生活变得更简单的工具.
testthat – 一个R包测试工具.
R6 – simpler, faster, lighter-weight alternative to R’s built-in classes.
pryr – Make it easier to understand what’s going on in R.
roxygen – 在函数定义中描述说明.
lineprof – R中在线分析结果可视化.
packrat – 让R项目更加简单,便携和可重构的工具.
installr – R中按照软件的相关函数(Windows平台).
import – R的导入机制.
modules – 另外一个R模块系统(Python风格).
Rocker – R configurations for Docker.
RStudio Addins – RStudio插件列表.
drat – Creation and use of R repositories on 使用R在GitHub或其他平台创建和使用仓储.
covr – Test coverage for your R package and (optionally) upload the results to coveralls or codecov.
lintr – R静态代码分析.
staticdocs – 为一个R包生成静态html文档.
futile.logger – R中类似log4j的日志记录包.
log4r – R中的log4j接口.
logging – 一个在R中实现log4j的日志处理包.
engsoccerdata – 英国和欧洲联赛结果数据(1871-2016年).
gapminder – 从Gapminder摘录的数据集.
git2r – 在R中使用git.
CXXR – Refactorising R into C++.
fastR – FastR is an implementation of the R Language in Java atop Truffle and Graal.
incanter – Clojure-based, R-like statistical computing and graphics environment for the JVM with Lisp spirit.
pqR – 一个更快的R实现.
renjin – 一个基于JVM的R编译器.
rho – Refactor the interpreter of the R language into a fully-compatible, efficient, VM for R.
riposte – 一个R快速编译和JIT工具.
RRO – R革命性开放平台(Microsoft R Open).
TERR – R的TIBCO企业运行环境.
swirl – 一个在R控制台中交互式学习指南.
DataScienceR – 一个数据科学,神经网络,和机器学习的指南.
R-project – R 项目的官方网站.
R Bloggers – R语言的一个综合性博客网站.
DataCamp – 在线学习R数据分析.
Quick-R – 一个非常好的快速参考手册.
Advanced R – 书籍高级R编程的在线版.
Efficient R Programming – 书籍”Efficient R Programming”的在线主页.
CRAN Task Views – CRAN包的任务列表.
The R Programming Wikibook – 一个R协作手册
R-users – R语言的求职板块.
R Cookbook – 一个R问答网站,由[R Graphics Cookbook]进行支持(//shop.oreilly.com/product/0636920023135.do).
tryR – 快速开始使用R.
RDocumentation – 使用RDocumentation搜索所有的CRAN, Bioconductor, Github包和文档.
R Books List – R相关书籍清单.
The Art of R Programming – 一个很好的资源,可以系统地学习基础类型的对象,控制语句,变量的范围,以及调试等.
Free Books – CRAN贡献的多种语言文档. Contributed Documentation in many languages.
R Cookbook – 快速简单的介绍R及相关常见的统计任务.
Johns Hopkins编写的数据科学专业的一部分教程:
Exploratory Data Analysis with R – 基本的各种数据分析技能. * R Programming for Data Science – 依赖于R的一些高级数据分析. * Report Writing for Data Science in R – R语言的报表生成和可重用组件研究.
R Packages – 一个用R包编写的书籍 (有论文和网站2钟格式).
R in Action – 一本旨在帮助所有级别R用户的书籍.
Use R! – This series of inexpensive and focused books from Springer publish shorter books aimed at practitioners. Books can discuss the use of R in a particular subject area, such as Bayesian networks, ggplot2 and Rcpp.
R for SAS and SPSS users – 一个对已经熟悉SAS和SPASS用户的资源库.
An Introduction to R – 一个很好的介绍R的文章,也涵盖了一些高级主题. >>>//cran.r-project.org/doc/manuals/R-intro.pdf官网
Introduction to Statistical Learning with Application in R – A simplified and “operational” version of The Elements of Statistical Learning. Free softcopy provided by its authors.
The R Inferno – Patrick Burns gives insight into R’s ins and outs along with its quirks!
R for Data Science – Free book from RStudio developers with emphasis on data science workflow. >>>官网
R Reference Card 2.0 – Material from R for Beginners by permission of Emmanuel Paradis (Version 2 by Matt Baggott).
Regression Analysis Refcard – R Reference Card for Regression Analysis.
Reference Card for ESS – Reference Card for ESS.
R Markdown Cheat sheet – Quick reference guide for writing reports with R Markdown.
Shiny Cheat sheet – Quick reference guide for building Shiny apps.
ggplot2 Cheat sheet – Quick reference guide for data visualisation with ggplot2.
devtools Cheat sheet – Quick reference guide to package development in R.
The Analytics Edge – Hands-on introduction to data analysis with R from MITx.
Johns Hopkins University Data Science Specialization – 9 courses including: Introduction to R, literate analysis tools, Shiny and some more.
HarvardX Biomedical Data Science – Introduction to R for the Life Sciences.
Explore Statistics with R – Covers introduction, data handling and statistical analysis in R.
Books – R书籍清单.
DataScienceR – R数据科学、神经网络和机器学习的指南清单.
ggplot2 Extensions – ggplot2扩展案例.
Natural Language Processing – R. @Chinese中NLP 相关资源.
Network Analysis – 网络分析相关资源.
Open Data – 使用R获取,转换,操作,创建和贡献数据.
Posts – 创建R博客或者文章.
Package Development – 提高包开发的资源工具.
R Project Conferences – 使用R的相关信息,DSC会议.
RStartHere – 一些非常有用的R包指南.
RStudio Addins – RStudio插件清单.
Topic Models – 主题模型的学习和R相关资源.
Web Technologies – 如何使用R和万维网的信息.
End.
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